视察了三个武器工坊之后，在兵部的一间小跨院内，朱由检和兵部、工部的两位尚书对武器工坊的工作进行讨论。
不管是工部尚书薛凤翔还是兵部尚书王在晋，对于军器局、兵仗局、局的混乱早就有所耳闻，但是他们显然没想到会是这么触目惊心的局面。
不过两位尚书同样知道，围绕着这三个武器制作局的背后，是牵涉到工部、兵部官员胥吏还有宫内太监们的庞大利益，就算他们身为两部尚书，也一样有些得罪不起。
看着两名尚书期期艾艾了半天，也只得出了一个更换军器局、兵仗局、局正副大使的一个提议，朱由检终于有些忍耐不住了。
“这三个局已经从上到下烂到根子里了，只更换两个主官会有用吗？从原料进出口到武器入库，那个地方没有贪污腐败的痕迹？两位尚书的建议，不过是换汤不换药罢了。”朱由检脸色严峻的的说道。
工部尚书薛凤翔不由小声辩解道：“军器局、兵仗局、局不仅仅支持这京营军士的武器、铠甲、供应，还担负了一部分辽东军的武器供应，如果大动干戈的进行调整，臣恐怕会耽误辽东的军务啊。”
“让军士们拿这样的武器装备去作战，和让他们赤手空拳上战场有什么区别？朕觉得长痛不如短痛，中断一段时间的武器供应，也比常年提供不合格的武器装备要好。”朱由检毫不客气的反驳了薛凤翔的说法。
王在晋和薛凤翔对视了一眼之后，就对着崇祯说道：“那么陛下想要如何整顿三局？”
朱由检考虑了下就说道：“三局合一，改名为北直隶兵工厂，取消各局的监督内臣，兵工厂不再接受工部管理，而是划到兵部名下。兵工厂内的工匠将免去匠籍的约束，不再执行班役政策。
兵部对兵工厂有监管的权力，但不再负责直接营运。工部原向各地征收的制造原料，改成折色由户部征收。兵工厂按照五军都督府的武器数量进行生产，原料自行购买。
兵部的武库划归五军都督府经历司管理，不过兵部可以继续监管武库的运行。每年五军都督府采购的武器数量由兵部进行审核，兵部批准之后方可进行采购。”
崇祯的改革方案，最吃亏的是工部，丢失了三个局的管理权力，和对地方矿场的征税权。
兵部失去了武库的大半个管理权，却得到了兵工厂的管理权力，表面上看并不算吃亏。
而收益最大的反而是五军都督府，不但白白得到了一个武库管理权，还有权力进行每年的武器订单数量的制定。
王在晋、薛凤翔只是思考了片刻就附和了崇祯的建议，一方面是因为，三局的弊端实在是到了非改不可的地步；另一方面则是，崇祯借着闻香教变乱的由头，用锦衣卫控制了整个京城的局势，两名尚书无意和现在风头最旺盛的皇帝进行角力。
不过两名尚书的妥协，并不代表下属官吏的放弃。当日中午，得到皇帝命令的王世德，带着五军都督府经历司都事言成泽抵达兵部武库司，想要接收兵部管理的武库账册。
不料却被兵部武库司主官郎中陈国器所阻，这位天启二年的进士，以陛下之命违背了祖制为由，拒绝把武库交给五军都督府管理，
就连兵部尚书王在晋出来劝解，也被陈国器训斥为，附和皇帝擅改官制，是媚上之小人，直接把王在晋给气走了。
这陈国器一番大闹，惹得整个兵部的官员都聚集到院子内看热闹了。这些官员本身就对锦衣卫没什么好感，在加上一向被兵部官员看不起的五军都督府，居然敢来抢夺兵部官员的利益，顿时让他们开始声援起陈国器来了。
武库司的属官，一名员外郎，两名主事，在这种声势下，根本对王世德的威胁充耳不闻，一点也没有协助王世德的意思。
年轻气盛的王世德，顿时有些气血翻腾，想要下令手下抓人，不过一直冷眼旁观的言成泽却拉住了他。
“千户大人请息怒，这事有蹊跷啊。”言成泽紧紧拉着王世德的衣襟说道。
“有什么蹊跷的，这摆明是目无圣上，是要造反啊。”王世德一边挣脱着，一边说道。
“请大人好好想想，陛下不过是要我们来接收账册，可没说让我们抓人。要是事情闹大了，陛下难道不会责怪大人办事不利吗？”
言成泽的话语终于让王世德冷静了下来，这武库司郎中是正五品的文官，放在地方也就是知府一级，但是在京城的五品文官，却正是处于要升任高级官职的前奏。